需要注意的是，具体的办理流程可能会因地区、企业性质或相关规定而有所不同，建议在具体操作之前，咨询当地相关部门，以确保按照相关规定正确办理。
牡丹江变更水路运输经营范围许可的流程一般包括如下步骤：
1. 准备材料：准备相关申请材料，包括申请表、企业法人营业执照等证件、法人代表身份证明、经营范围变更的证明文件等。
2. 提交申请：将准备好的材料提交给相关部门，一般为牡丹江市交通局或运输管理部门。
3. 材料审核：相关部门将对提交的材料进行审核，包括确认企业的合法性、经营范围变更的合规性等。
4. 物理勘察：相关部门可能会对企业的实际经营情况进行勘察，以确保其符合要求。
5. 审批：经审核合格后，相关部门会进行审批，决定是否同意变更水路运输经营范围的许可。
6. 颁发许可证：如审批通过，相关部门会颁发变更后的水路运输经营范围许可证。
需要注意的是，具体的办理流程可能会因地区、企业性质或相关规定而有所不同，建议在具体操作之前，咨询当地相关部门，以确保按照相关规定正确办理。